“Phim Fullmetal Alchemist: The Revenge of Scar xoay quanh việc một hình tượng bí ẩn bắt đầu nhắm vào các Nhà Alchemist Nha nghiệp vì tội lỗi của họ trái với Thượng đế. Trong lúc đó, Alchemist Edward Elric và em trai Alphonse đang trong tình trạng yếu đuối nhất của họ, trong khi những sinh linh nhân tạo bắt đầu tự mình tiết lộ lời đồn đại một lần nữa.”