Sau thất bại nghiêm trọng tại Đảo Nublar, công viên khủng long đã bị hoàn toàn phá hủy sau cơn bão tàn phá. John quyết định tiếp tục tổ chức cuộc chuyến thám hiểm thứ hai tới hòn đảo được gọi là Sorna. Thực tế, đây chính là hòn đảo thứ hai, nơi mà các dị vật đã được nuôi dưỡng và ấp trứng trước khi được chuyển đến Nublar. Trong cuộc hành trình này, anh kèm theo Tiến sĩ Sara Harding, bạn gái của Tiến sĩ Ian Malcolm, người đã xuất hiện trong phần một. Anh không biết trước rằng cô sẽ tham gia vào chuyến đi đến đảo Sorna, và anh tự biết rằng cuộc hành trình này rất nguy hiểm, nhất là khi Ian từng trải qua kinh nghiệm đảo Nublar. Tuy nhiên, anh quyết định mạo hiểm để đưa Laura, con gái mình, về an toàn. Khi đến đảo, anh mới nhận ra rằng thực chất đây là một cuộc săn lùng khủng long quy mô lớn, với mục tiêu bắt chúng và mang về thành phố San Francisco, nơi đã xây dựng sẵn công viên khủng long mới.
